水稻ssr标准，水稻slr1
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1、怎么根据物理位置下载水稻序列
进入这个网站：http：//www.ricedata.cn/gene/ 选择你想下载的 点进去，下载 水稻（Oryza sativa L.）是最重要粮食作物之一，也是世界1/2以上人口的主食，与其相关的遗传学和分子生物学研究一直倍受研究者的重视。
有以下方法：从公共数据库中下载：目前已有人对水稻进行了基因组测序，同时，也有许多水稻的全长cDNA序列被测定并上传到公共数据库中，如NCBI、EnsemblPlants和GRIN-Global等，可以在这些数据库上下载水稻的cDNA序列数据。
INE基因组数据库（整合的水稻基因组浏览器）整合了迄今为止已累计的水稻基因组信息，并且把它们与基因组序列相关联。
方法如下：进入这个网站。选择你想下载的。点进去，下载就可以了还是比较简单。
2、遗传多样性分析用的ssr越多越好吗
SSR（Simple Sequence Repeat）是一种DNA序列，由几个到几十个重复的核苷酸组成。SSR在基因组中广泛存在，且具有较高的多态性，因此常用于遗传分析和指纹图谱制作。
现在没有一个推荐的标准取样方案，但基本原则是在财力允许的情况下，取样的个体越多、取样的位点越多、取样的群体越多越好。遗传距离的估算 遗传距离指个体、群体或种之间用DNA序列或等位基因频率来估计的遗传差异大小。
使用GenAlex分析遗传多样性参数，但是不太明白这些参数的含义，还担心在计算的过程中会遗漏数据，就跑2次，看下结果一样不 分不同地区比较不同种源的遗传多样性指数差异。
ssr分析技术特点 （1）数量丰富，覆盖整个基因组，揭示的多态性高。（2）具有多等位基因的特性，提供的信息量高。
3、SSR标记的分类
目前发现的串联重复序列主要有两类：一类是由功能基因组成的（如rRNA和组蛋白基因）；另一类是由无功能的序列组成的。根据重复序列的重复单位的长度，可将串联重复序列分为卫星DNA、微卫星DNA、小卫星DNA等〔3〕。
复合型（compound）。指2个或2个以上的串联核心序列由3个或3个以上的连续的非重复碱基分隔开，但这种连续性的核心序列重复数不少于5。如：ATATATATATATATGGGATATATATATATA 3种类型中完全型是SSR标记中应用较多的一种类型。
SSR是各种卡牌类游戏中的卡，卡牌稀有度级别分类的一种，TR卡是普通卡。
SSR（Simple Sequence Repeats）标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术，也称为微卫星DNA（MicrosatelliteDNA），是一类由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。
Morgante和Olivieri（1993）指出用PCR扩增的SSR可以用作植物的分子标记，SSR已经用于植物的遗传作图（Bell and Ecker，1994）。
4、普通野生稻的遗传研究
中国是普通野生稻的遗传多样性中心之一。在长期的自然演变过程中，普通野生稻居群内任何个体任何位点上的遗传变异都会在居群内累积，因此，普通野生稻的居群遗传结构具有高度的异质性，即同一居群不同个体间基因型往往不同。
普通野生稻是短日照植物，但喜阳光充足，适生于低洼、积水的浅水层沼泽中生长。
首先通过Est-x同工酶分析，将供试的普野材料鉴别为杂合型、栽培型与纯合型3类，再对鉴定出的92份纯合型普通野生稻进行4个同工酶基因位点分析。
由于野生稻遗传异质性高、不利基因出现频率高且多与有利基因连锁等要素的影响，使用野生稻进行水稻品种改良周期长、成功率低。
新型杂交水稻 杂交水稻：杂交水稻是袁隆平培育出的高产杂交水稻品种，是由普通稻与在海南发现的野生稻杂交，获取了杂种优势，培育出的水稻品种。
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