水稻ssr标记查找-水稻数据库,水稻分析系统
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1、普通野生稻的遗传研究
普通野生稻在我国南方分布较广，面积亦大，变异类型十分丰富，保护和收集野生近缘植物基因，为遗传育种研究所必须，具有重要实践意义和科学价值。保护措施：作适当的产地保护。多年生水生草本，秆高约150厘米，下部海绵质。
中国是普通野生稻的遗传多样性中心之一。在长期的自然演变过程中，普通野生稻居群内任何个体任何位点上的遗传变异都会在居群内累积，因此，普通野生稻的居群遗传结构具有高度的异质性，即同一居群不同个体间基因型往往不同。
首先通过Est-x同工酶分析，将供试的普野材料鉴别为杂合型、栽培型与纯合型3类，再对鉴定出的92份纯合型普通野生稻进行4个同工酶基因位点分析。
由于野生稻遗传异质性高、不利基因出现频率高且多与有利基因连锁等要素的影响，使用野生稻进行水稻品种改良周期长、成功率低。
普通野生稻稻褐飞虱抗源的杂交利用技术及其获得的一大批抗性创新种质和育种品系。
2、SSR标记的分类
目前发现的串联重复序列主要有两类：一类是由功能基因组成的（如rRNA和组蛋白基因）；另一类是由无功能的序列组成的。根据重复序列的重复单位的长度，可将串联重复序列分为卫星DNA、微卫星DNA、小卫星DNA等〔3〕。
复合型（compound）。指2个或2个以上的串联核心序列由3个或3个以上的连续的非重复碱基分隔开，但这种连续性的核心序列重复数不少于5。如：ATATATATATATATGGGATATATATATATA 3种类型中完全型是SSR标记中应用较多的一种类型。
SSR是各种卡牌类游戏中的卡，卡牌稀有度级别分类的一种，TR卡是普通卡。
SSR（Simple Sequence Repeats）标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术，也称为微卫星DNA（MicrosatelliteDNA），是一类由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。
3、ssr标记的图谱怎么看
首先在电脑上打开ssr结果图。然后在结果图下方找到设置。然后在设置中找到形状设置。最后点击形状即可查看是否带形。
然后用高浓度琼脂糖凝胶或变性聚丙稀酰胺凝胶电泳进行分析。由于SSR多态性是由简单序列重复次数的差异引起的，因此在扩增的PCR带上会出现小片段或不连续的带。
因而目前该技术已广泛用于遗传图谱的构建〔11，12，18，19，33〕、目标基因的标定〔8，9，21，22，26〕、指纹图〔22〕的绘制等研究中。
ssr引物01数据怎么看多态性 SSR标记又称为sequence tagged microsatellite site，简写为STMS，是目前最常用的微卫星标记之一。
4、ssr标记技术的原理
由于SSR重复数目变化很大，所以SSR标记能揭示比RFLP高得多的多态性，这就是SSR标记的原理。
原理：在真核生物的基因组中，每个SSR序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大，因此形成其座位的多态性，并且每个SSR座位两端有一段保守的DNA序列。
由于SSR重复数目变化很大，所以SSR标记能揭示比RFLP高得多的多态性，这就是SSR标记的原理。
虽然SSR在基因组上的位置不尽相同，但是其两端序列多是保守的单拷贝序列，因此可以用微 卫星区域特定顺序设计成对引物，通过PCR技术，经聚丙烯酰胺凝胶电泳，即可显示SSR位点在不同个体间的多态性。
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